O Departamento de Patologia está estruturado acadêmica, cientifica e fisicamente para o desenvolvimento de atividades de ensino, pesquisa e extensão. Para tanto, ministra disciplinas de graduação e pós-graduação, gera publicações em revistas indexadas, bem como obtem recursos junto a agências de fomento, particularmente a FAPESP e o CNPq, e divulga seus trabalhos em eventos científicos. Acrescente-se a estes, atividades de extensão junto ao Hospital Veterinário da FMVZ – USP, e de formação de recursos humanos em diferentes níveis, ou seja, estágios, iniciação científica, residência, práticas profissionalizantes e formação de mestres e doutores, inclusive com o aceite de doutores para a realização de pós-doutoramento. Possui 12 laboratórios de pesquisa que permitem receber estagiários e oferecer serviços.